Episodeguide: Sesong 1 | Sesong 2 | Sesong 3 | Sesong 4 | Sesong 5 | Sesong 6
Episode 32. Dark Matter
Larry og Megan på date
To menn går inn på en skole og begynner å skyte vilt, og dreper åtte, og sårer 12 elever og lærerer. Den ene av angriperene blir drept av partneren sin, mens den andre stikker av.
Den drepte angriperen er elev på skolen, så de regner med at også den andre er det, men det er en stor skole, og det er veldig mange kandidater.
Elevene er utstyrt med en GPS sporing, ikke alle elevene har den på seg, men Don mener at med den som utgangspunkt og god hjelp fra Charlie kan eliminere en god del mistenkte, men det brøt ut fullstendig kaos da de begynte å skyte og Charlie er ikke sikker på om det er hensiktsmessig. Det er også ett åpent spørsmål hvordan de fikk inn våpnene, for skolen har vakter og metalldektektor.
Charlie mener at han kan se hvor angriperne kom inn og begynte å skyte ved hjelp av fluktmønsteret til elevene, og vil begynne der.
Drapsmannen som ble skutt er medlem av en "spillklan", og det er stort sett det eneste sosiale nettverket han har, så de begynner der. Ett av medlemene av klanen, Justin, har en stor våpensamling som han har arvet etter sin avdøde onkel og er veldig opptatt av det som skjedde i Columbine. De finner han på den lokale internettkafeen. Han prøver å skyte seg ut, men blir skutt av politiet.
En masse våpen er forsvunnet, og en rekke utsabile tenåringsgutter kan ha hatt tilgang til dem og det haster med å finne dem.
De finner ut at Justin har lei ett lite lager i morens navn, der finner de tegninger fra skolen og sikkerhetsplanen som viste at en av metalldetektorene var ute av drift, pluss amunisjon, men ingen våpen.
På Justins laptop finner de også ett hjemmelaget spill, som foregår i gangene inne på skolen
Charlie har rekonstruksjonen klar og han konkluderer med at det var enda en skytter inne på skolen. Megan vil se nærmere på medlemmene av "klanen", men blir stoppet av skolens rektor. Foreldrene til de resterende medlemmene av klanen mener at sønnene blir trakasert og har tatt rettslig skritt for å stoppe at skolen deler ut opplysninger om dem. Hun omgår det ved å samle informasjon fra andre registrer og lar Charlie utvikle ett program som trekker ut de opplysningene de trenger, men Charlie har ikke nok informasjon. Så finner de at lederen for klanen, Gregory, har sendt ut en mail til alle medlemmene dagen før angrepet og bedt dem være forsiktige neste dag. Det er nok til å få en rettsordre for å se hans mappe.
Gregory blir tatt like ved hjemmet, med en bag med våpen, og han har brutt seg inn på skolens datasystem. Han forteller at han og Justin bare skjøt på blink, og at han hacket seg inn på skolens datasystem for å finne informasjon om spillet han laget. Mailen som ble sendt for å advare medlemmene ble sendt via hans adresse, men ikke av han, den ble sendt fra en maskin på skolen mens han var hjemme, og ingen av våpnene han var i besittelse av ble brukt under angrepet.
Charlie finner ut at den tredje skytteren beveget seg ulogisk. Han jaktet på elever ved hjelp av GPS, og han var på jakt etter skolenes tre ledende atleter.
De ser nærmere på disse tre og finner to sammenhenger. De er alle involvert i en dopskandale med anabole steorider, og alle tre ble anmeldt etter bråk på en fest. Gjestelista fra festen blir sjekket og der finner de navnet på den jenta som er redaktør i skoleavisa, hun avslørte dopskandalen og hun skrev fordelaktig om "nerdene" i klanen. Hun forteller at de tre guttene voldtok henne på festen som hevn for artikkelen hun skrev og at hun manipulerte nerdene til å utføre drapsplanen. Hun sørget også for at ei jente som inviterte henne på festen og var med på å dope henne ned ble drept.